Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc4Q6S5L9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shc4Q6S5L9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms