Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NfrkbQ6PIJ4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfrkbQ6PIJ4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NfrkbQ6PIJ4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NfrkbQ6PIJ4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NfrkbQ6PIJ4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NfrkbQ6PIJ4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfrkbQ6PIJ4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfrkbQ6PIJ4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfrkbQ6PIJ4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfrkbQ6PIJ4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfrkbQ6PIJ4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfrkbQ6PIJ4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfrkbQ6PIJ4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfrkbQ6PIJ4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms