Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf4Q6PFF0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms