Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rad54bQ6PFE3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad54bQ6PFE3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms