Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms