Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms