Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Lce3fQ6PAI4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms