Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Podnl1Q6P3Y9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms