Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms