Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpdc1Q6NZK8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpdc1Q6NZK8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms