Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad17Q6NXW6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad17Q6NXW6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rad17Q6NXW6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad17Q6NXW6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad17Q6NXW6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms