Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms