Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt40Q6IFX3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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