Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Hecw2Q6I6G8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms