Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Edrf1Q6GQV7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms