Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6DFW0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6DFW0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6DFW0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6DFW0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6DFW0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6DFW0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6DFW0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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