Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rftn1Q6A0D4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms