Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fgd6Q69ZL1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fgd6Q69ZL1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Fgd6Q69ZL1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fgd6Q69ZL1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fgd6Q69ZL1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fgd6Q69ZL1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fgd6Q69ZL1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fgd6Q69ZL1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fgd6Q69ZL1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fgd6Q69ZL1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fgd6Q69ZL1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fgd6Q69ZL1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fgd6Q69ZL1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Fgd6Q69ZL1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fgd6Q69ZL1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms