Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ric1Q69ZJ7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ric1Q69ZJ7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ric1Q69ZJ7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ric1Q69ZJ7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ric1Q69ZJ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ric1Q69ZJ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ric1Q69ZJ7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ric1Q69ZJ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ric1Q69ZJ7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ric1Q69ZJ7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ric1Q69ZJ7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ric1Q69ZJ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ric1Q69ZJ7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ric1Q69ZJ7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ric1Q69ZJ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ric1Q69ZJ7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ric1Q69ZJ7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms