Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CilpQ66K08 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CilpQ66K08 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms