Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms