Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usf2Q64705 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf2Q64705 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms