Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms