Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Surf4Q64310 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms