Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlh2Q64221 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms