Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PatjQ63ZW7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PatjQ63ZW7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms