Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vil1Q62468 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vil1Q62468 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms