Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm20854Q62461 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20854Q62461 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20854Q62461 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20854Q62461 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20854Q62461 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20854Q62461 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20854Q62461 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20854Q62461 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20854Q62461 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20854Q62461 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20854Q62461 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20854Q62461 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20854Q62461 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20854Q62461 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20854Q62461 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20854Q62461 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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