Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SypQ62277 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SypQ62277 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SypQ62277 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SypQ62277 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SypQ62277 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SypQ62277 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SypQ62277 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SypQ62277 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SypQ62277 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SypQ62277 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SypQ62277 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SypQ62277 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SypQ62277 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SypQ62277 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SypQ62277 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SypQ62277 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SypQ62277 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SypQ62277 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SypQ62277 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SypQ62277 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SypQ62277 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SypQ62277 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SypQ62277 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SypQ62277 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SypQ62277 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SypQ62277 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SypQ62277 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SypQ62277 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SypQ62277 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SypQ62277 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SypQ62277 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SypQ62277 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SypQ62277 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SypQ62277 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SypQ62277 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SypQ62277 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SypQ62277 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SypQ62277 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SypQ62277 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SypQ62277 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SypQ62277 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SypQ62277 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SypQ62277 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SypQ62277 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SypQ62277 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SypQ62277 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SypQ62277 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SypQ62277 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SypQ62277 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SypQ62277 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SypQ62277 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SypQ62277 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SypQ62277 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SypQ62277 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SypQ62277 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SypQ62277 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SypQ62277 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SypQ62277 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms