Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms