Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn9aQ62205 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn9aQ62205 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms