Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga6Q61739 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms