Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gli3Q61602 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gli3Q61602 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gli3Q61602 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms