Protein–RNA interactions for Protein: Q61205

Pafah1b3, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b3Q61205 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pafah1b3Q61205 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 250.6 ms