Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Foxd3Q61060 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd3Q61060 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms