Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NinQ61043 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NinQ61043 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NinQ61043 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NinQ61043 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NinQ61043 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NinQ61043 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NinQ61043 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NinQ61043 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NinQ61043 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NinQ61043 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NinQ61043 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NinQ61043 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NinQ61043 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NinQ61043 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NinQ61043 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NinQ61043 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NinQ61043 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NinQ61043 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NinQ61043 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NinQ61043 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NinQ61043 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NinQ61043 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NinQ61043 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NinQ61043 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NinQ61043 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NinQ61043 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NinQ61043 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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NinQ61043 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NinQ61043 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NinQ61043 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NinQ61043 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NinQ61043 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NinQ61043 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NinQ61043 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NinQ61043 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NinQ61043 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NinQ61043 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NinQ61043 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NinQ61043 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NinQ61043 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NinQ61043 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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NinQ61043 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NinQ61043 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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NinQ61043 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NinQ61043 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinQ61043 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinQ61043 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinQ61043 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinQ61043 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinQ61043 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinQ61043 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinQ61043 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinQ61043 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinQ61043 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinQ61043 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NinQ61043 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinQ61043 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinQ61043 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NinQ61043 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NinQ61043 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NinQ61043 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NinQ61043 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NinQ61043 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NinQ61043 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NinQ61043 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NinQ61043 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NinQ61043 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NinQ61043 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NinQ61043 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NinQ61043 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NinQ61043 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NinQ61043 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NinQ61043 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NinQ61043 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NinQ61043 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NinQ61043 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NinQ61043 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NinQ61043 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NinQ61043 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NinQ61043 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinQ61043 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinQ61043 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NinQ61043 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinQ61043 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinQ61043 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinQ61043 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinQ61043 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NinQ61043 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinQ61043 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinQ61043 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinQ61043 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinQ61043 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinQ61043 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NinQ61043 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms