Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp4Q60972 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms