Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot7Q60809 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cnot7Q60809 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot7Q60809 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms