Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Traf3Q60803 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf3Q60803 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf3Q60803 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms