Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfkbibQ60778 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfkbibQ60778 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms