Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2cQ60772 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2cQ60772 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2cQ60772 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2cQ60772 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2cQ60772 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2cQ60772 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdkn2cQ60772 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdkn2cQ60772 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdkn2cQ60772 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkn2cQ60772 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2cQ60772 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms