Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf3Q60765 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf3Q60765 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms