Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PmelQ60696 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PmelQ60696 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PmelQ60696 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PmelQ60696 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms