Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm1Q60636 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms