Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms