Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsr1Q5SWD9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsr1Q5SWD9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms