Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc42Q5SV66 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc42Q5SV66 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms