Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ankrd40Q5SUE8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms