Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme4Q5SSW2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Psme4Q5SSW2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psme4Q5SSW2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psme4Q5SSW2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms