Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Utp18Q5SSI6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms